Fakultas Kedokteran Universitas Cenderawasih menjadi institusi Pendidikan Kedokteran dan Keperawataan yang unggul, Berkarakter Budaya, dan Maju dalam bidang Kedokteran Tropis di Indonesia dan Kepulauan Pasifik Tahun 2045
MISI
Mengutakan tata kelola yang bersih, transparan, akuntabel, dinamis dan progresif
Menguatkan SDM akademik dan non-akademik
Menguatkan ketersediaan sarana dan prasarana
Menguatkan proses belajar mengajar yang sesuai dengan konteks sosial-budaya dan mengikuti perkembangan jaman
Menguatkan iklim akademik dalam rangka pengembangan penelitian dan pengabdian masyarakat yang berbasis bukti
Menguatkan sistem evaluasi, monitoring dam pemeliharaan